腸道原生菌是一種存在于人類及動物的腸道中的微生物群落。它們主要包括細菌、真菌、放線菌和病毒等微生物，其中最主要的是細菌。腸道原生菌在腸道內起著重要的生理功能，如幫助消化食物、合成維生素、調節免疫系統等。它們還與宿主的健康密切相關，不僅可以幫助維持腸道的健康，還與多種疾病的發生和發展有著密切的關系，如腸道炎癥、肥胖、自身免疫性疾病等。研究腸道原生菌及其功能對于維護人體健康具有重要意義。