1. 身份：支原體是一種細菌樣微生物，但不屬于細菌，而是單細胞生物中的獨立分支，獨立成為一個界；而細菌屬于真細菌。

　　2. 細胞結(jié)構(gòu)：支原體與細菌的細胞結(jié)構(gòu)存在一定的區(qū)別。支原體的細胞膜上沒有脂肪酸鏈，僅有磷脂和膽固醇等組成。支原體的DNA相對較小，沒有真正意義的細胞壁，而細菌的細胞壁分為革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌。

　　3. 養(yǎng)分：支原體能夠自主合成ATP，具有代謝能力，因此能夠進行分裂繁殖。而細菌則需要從外界獲取養(yǎng)分才能進行生長和繁殖。

　　4. 難治性：支原體感染比細菌更難治療，因為支原體生長緩慢，令抗生素很難到達其位于細胞內(nèi)的基因組。

　　5. 病原性：支原體和細菌對宿主的危害程度和病癥也有所不同。支原體可以導(dǎo)致肺炎和性病等疾病，嚴(yán)重者可致死，而細菌則不但有許多引起人類疾病的致病菌，而且也有許多對人類有益的細菌。