采集腸道菌群的常用方法是通過糞便樣本進行。具體操作步驟如下：

　　1. 準備好采集容器：使用無菌的容器，通常可以使用消毒過的塑料袋或容器。

　　2. 進行糞便采集：使用一次性的手套，并放置在馬桶上。使用便盆或塑料薄膜覆蓋馬桶，以防止污染。在開始排便之前，將容器置于馬桶上方并打開容器蓋。在排便過程中，用勺子或便盆將適量的糞便采集到容器中。

　　3. 關(guān)閉容器：將蓋子緊密地蓋在容器上，確保容器密封。避免手部接觸糞便。

　　4. 清洗和消毒：丟棄手套并清洗手部。如果容器外部有糞便殘留，需要用消毒劑擦拭容器。

　　5. 存儲樣本：將采集好的樣本放入冰箱，并盡快送往實驗室進行分析。在運送過程中，要保持樣本的低溫，以確保菌群的完整性。

　　在進行腸道菌群采集前，應盡量避免攝入抗生素、益生菌等可能干擾菌群分析的藥物或食物。為了確保采集到準確的菌群信息，建議在連續(xù)三天內(nèi)連續(xù)采集樣本，以獲得更全面和穩(wěn)定的結(jié)果。