臉上長痘痘的主要是皮脂腺毛囊周圍的厭氧菌和細菌，特別是痤瘡丙酸桿菌（Propionibacterium acnes）和金黃色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）。這些菌群會破壞毛囊和皮脂腺的正常代謝，導致皮膚發炎和痘痘。長期使用抗生素也可能導致皮膚菌群的失衡，進而引發痘痘。