綠豆芽變紅的原因可能是由于過度生長或者病蟲害感染引起的。如果綠豆芽出現紅色部位，建議不要食用，因為紅色部位可能是細菌或霉菌感染的產物，對健康有害。在種植過程中，要保證衛生環境和水源的清潔，以預防細菌和霉菌的污染。