蛋白分解菌是一類能夠分解蛋白質的微生物，它們可以促進有機物質分解和循環，提高土壤肥力，對環境和植物生長具有一定的促進作用。在一定范圍內，蛋白分解菌被認為是有益菌。過多的蛋白分解菌有可能引起土壤酸化和病原菌繁殖，會對植物生長產生負面影響。