健康人的胃腸道內寄居著種類繁多的微生物，這些微生物稱為腸道菌群。為什么會得腸道菌群失調癥?病因有哪些?原來腸道菌群按一定的比例組合，各菌間互相制約，互相依存，在質和量上形成一種生態平衡，一旦機體內外環境發生變化，特點是長期應用廣譜抗生素，敏感腸菌被抑制，未被抑制的細菌而乘機繁殖，從而引起菌群失調，其正常生理組合被破壞，而產生病理性組合，引起臨床癥狀就稱為腸道菌群失調癥。本癥的發生率約為2%～3%。

　　一、飲食因素：運用測定細菌酶類的方法研究菌叢代謝活性的結果表明，飲食可使糞便菌叢發生明顯改變。無纖維食物能促進細菌易位。SpaethG用大鼠作試驗研究，結果表明食物纖維能維持腸道菌群正常生態平衡，且細菌代謝纖維的終產物對小腸上皮有營養作用，纖維能維持腸粘膜細胞的正常代謝和細胞動力學。Hosoda等報道加入纖維的低渣飲食對保存腸的結構和功能有好的效果，纖維的保護作用是否通過直接刺激激腸粘膜或誘導釋放營養性胃腸激素尚不清除。食物纖維能減少細菌易位，但不能使屏障功能恢復至正常。

　　二、菌叢的變化因素：菌叢組成可因個體不同而存在差異，但對同一個人來說，在相當長的時期內菌叢組成十分穩定。每個菌種的生態學地位由宿主的生理狀態、細菌間的相互作用和環境的影響所確定。在平衡狀態下，所有的生態學地位都被占據。細菌的暫時棲生可使生態平衡發生改變。

　　三、藥物的代謝因素：腸道菌叢在許多藥物的代謝中起重要作用，包括乳果糖、水楊酸偶氮磺胺吡啶、左旋多巴等。任何抗生素都可導致結腸菌叢的改變，其取決于藥物的抗菌譜及其在腸腔內的濃度。氯林可霉素和氨芐青霉素可造成大腸內生態學真空狀態，使艱難梭菌增殖。應用甲氰咪胍等H2―受體拮抗劑可導致藥物性低胃酸和胃內細菌增殖。

　　四、年齡因素：隨著年齡的增高，腸道菌群的平衡可發生改變，雙尾菌減少，產氣莢膜桿菌增加，前者有可能減弱對免疫機能的刺激，后者導致毒素增加使免疫受到抑制。老年人如能維持年青時的腸道菌群平衡，也許能夠提高免疫能力。

　　五、胃腸道免疫功能障礙因素：胃腸道正常免疫功能來自粘膜固有層的漿細胞，漿細胞能產生大量的免疫球蛋白，即分泌型IgA，此為胃腸道防止細菌侵入的主要物質。一旦胃腸道粘膜合成單體，或雙體IgA，或合成分泌片功能發生障礙，致使胃腸道分泌液中缺乏分型IgA，則可引起小腸內需氧菌與厭氧菌過度繁殖，從而造成菌群失調，引起慢性腹瀉。無癥狀的IgA缺乏者，小腸內菌群亦可過度繁殖。新生兒期菌群失調發生率較高，亦可能與免疫系統發育未成熟或不完善有關。